More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1121 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 322 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.39 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  41.04 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  39.09 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  41.4 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 283 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.03 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.18 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.18 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.72 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  29.74 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.62 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.21 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.35 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.28 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  23.76 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.9 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.94 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.44 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1252  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.17 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13301  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.76 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  27.09 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.93 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.82 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.5 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.42 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>