More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4250 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
352 aa  673    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  47.66 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  46.04 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 
363 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 
303 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.07 
 
 
343 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  41.47 
 
 
304 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
304 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
311 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.56 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
308 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.46 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.91 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  25.46 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.89 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.61 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.03 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.03 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.21 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.07 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.35 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.91 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  31.42 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.64 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.57 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.1 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.1 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.1 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.78 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  22.53 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.3 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  22.41 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.87 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.45 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>