More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4590 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
327 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  47.73 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.12 
 
 
343 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  47.1 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  45.94 
 
 
304 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  44.56 
 
 
303 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  40.6 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 
366 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.6 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.04 
 
 
315 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.04 
 
 
315 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
305 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
311 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.2 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.55 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
462 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.76 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 
265 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.71 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.27 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  24.23 
 
 
304 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
312 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 
453 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.83 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  23.21 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.42 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  21.69 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.95 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.28 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.67 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.38 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.87 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
304 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.02 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.42 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.85 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>