More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0829 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  77.62 
 
 
288 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  74.05 
 
 
291 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  73.87 
 
 
290 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  73.45 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  67.25 
 
 
290 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  65.51 
 
 
290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
292 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
421 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
296 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
296 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
301 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.01 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
312 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  27.38 
 
 
303 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  26.88 
 
 
299 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.11 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0155  hypothetical protein  25.55 
 
 
306 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0704545  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.82 
 
 
331 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17911  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.16 
 
 
299 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.782041  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 
303 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
299 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
304 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18081  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.57 
 
 
299 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
302 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.91 
 
 
303 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
300 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  28.1 
 
 
323 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.3 
 
 
301 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  28.12 
 
 
318 aa  98.6  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17211  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.27 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  28.83 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1252  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.55 
 
 
316 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.12 
 
 
293 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1206  putative alpha/beta hydrolase superfamily  24.07 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13301  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.86 
 
 
313 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.95 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.17 
 
 
319 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20811  alpha/beta fold family hydrolase  23.73 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.509173  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  25.63 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.14 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  28.15 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.38 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13451  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.83 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.32 
 
 
371 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  25.17 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  25.44 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  24.01 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.1 
 
 
372 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  23.78 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.76 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.38 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  23.15 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.99 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.64 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  22.63 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.27 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.23 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
350 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.18 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.85 
 
 
370 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.43 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.43 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>