More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1600 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 		 371 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  65.14 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.31 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.31 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.28 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.27 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.05 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.11 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.07 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.53 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.03 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.46 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.49 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.53 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.51 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.23 
 
 		 370 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.68 
 
 		 380 aa  302  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.92 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.66 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.92 
 
 		 371 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.49 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 		 443 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.34 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  60.87 
 
 		 450 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  54 
 
 		 450 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.74 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.39 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 273 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 350 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.54 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.92 
 
 		 279 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.54 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.68 
 
 		 437 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.39 
 
 		 276 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.5 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 253 aa  93.6  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.81 
 
 		 99 aa  92.8  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 279 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 288 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 255 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 284 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 254 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 257 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.25 
 
 		 271 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.67 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 277 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  29.67 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 312 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  28.44 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 289 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 271 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.17 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 290 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 289 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.06 
 
 		 265 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 278 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 291 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 265 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 		 275 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  29 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>