More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2481 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 275 aa  546  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.52 
 
 		 453 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 462 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.39 
 
 		 462 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  23.41 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 		 456 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.86 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 421 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.2 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.5 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.38 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.21 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.63 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.63 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.22 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.71 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.69 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.42 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  28.73 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.07 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.23 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.91 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.23 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.25 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.29 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.23 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.9 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.1 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.42 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 562 aa  72.4  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.15 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>