More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1970 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
311 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  37.24 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  37.24 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
312 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
311 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
311 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
315 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
296 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.77 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
339 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
346 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.48 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.76 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.1 
 
 
291 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
290 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.9 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
258 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
322 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
340 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.54 
 
 
313 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
291 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
304 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.34 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.52 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  22.37 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.11 
 
 
443 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.54 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  21.55 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  21.55 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.88 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  21.55 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.81 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.81 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  23.66 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  24.81 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.81 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.44 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.81 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.47 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.86 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.19 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>