More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0119 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
380 aa  763    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.34 
 
 
374 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.61 
 
 
370 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.16 
 
 
370 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.84 
 
 
368 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.09 
 
 
370 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.38 
 
 
371 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.09 
 
 
368 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.51 
 
 
370 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.74 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.67 
 
 
370 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.51 
 
 
370 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.57 
 
 
371 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.05 
 
 
367 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.55 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.09 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.84 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.84 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.68 
 
 
371 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.76 
 
 
370 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.11 
 
 
371 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.02 
 
 
371 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.02 
 
 
371 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.8 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.99 
 
 
389 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.71 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.04 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
290 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.86 
 
 
461 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  55.43 
 
 
99 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
299 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
277 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.36 
 
 
398 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.92 
 
 
437 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
289 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
312 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.32 
 
 
293 aa  96.3  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
304 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
296 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
285 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
309 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
324 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
293 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.58 
 
 
324 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  46 
 
 
450 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
294 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
324 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
327 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
324 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
295 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
255 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
299 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
339 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
299 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
299 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
304 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  28.94 
 
 
287 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.32 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
291 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  41.13 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
255 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.84 
 
 
278 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  40.71 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.52 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
291 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
327 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
327 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
291 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
298 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
274 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  29.08 
 
 
294 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
327 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
286 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  28.21 
 
 
294 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
294 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
287 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.01 
 
 
453 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
293 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>