More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0847 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
404 aa  812    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  45.59 
 
 
268 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 
275 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  39.38 
 
 
267 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 
257 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
286 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
265 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
290 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 
273 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
287 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
265 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
298 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
273 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
299 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
329 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.11 
 
 
341 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
333 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.02 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
287 aa  87  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
266 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.53 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
322 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.35 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10991  Alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.312189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
275 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.41 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
504 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.23 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
253 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
267 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.57 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.81 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.6 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.78 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
284 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  29.81 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>