More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6643 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  100 
 
 		 275 aa  563  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  37.83 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  37.83 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 315 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 292 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 322 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.24 
 
 		 321 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.35 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 350 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 344 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 340 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 340 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 340 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  40 
 
 		 341 aa  92  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.15 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  31.83 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 344 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 340 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.46 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 366 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.77 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 333 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.32 
 
 		 369 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.47 
 
 		 368 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.1 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 361 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  28.32 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  35.86 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>