More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2137 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
363 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 
344 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.22 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
303 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 
352 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  40.59 
 
 
304 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 
327 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
308 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
296 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
317 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
304 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.86 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  29.56 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
315 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  30.31 
 
 
456 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 
265 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 
289 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.21 
 
 
299 aa  86.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  23.82 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.44 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.49 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  32 
 
 
275 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.04 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.74 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.74 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  26.2 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
310 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
302 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
504 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.06 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.99 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.71 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
270 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  21.61 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.97 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.09 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>