More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3860 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  99.65 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  90.59 
 
 		 288 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  89.9 
 
 		 288 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  82.93 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  59.93 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  44.48 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  42.55 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  33.68 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.93 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 361 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  31.14 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 226 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.04 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  30.26 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.25 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 		 369 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.53 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>