More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4130 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  95.68 
 
 
308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
286 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  39.21 
 
 
260 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.62 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
267 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
251 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
268 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 
226 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0172  hypothetical protein  60.81 
 
 
76 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
361 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.96 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.36 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.28 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.31 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.37 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  28.17 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
257 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.12 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.11 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>