199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  36.41 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  22.4 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  33.18 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  37.37 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  37.27 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  36.36 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  36.36 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  34.62 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 456 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.36 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.25 
 
 		 571 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  22.32 
 
 		 562 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52615  predicted protein  21.69 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0440889  normal  0.692936 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  22.61 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.32 
 
 		 387 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 462 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 453 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.13 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.71 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  29.55 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.62 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0446  triacylglycerol lipase, putative  28.87 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00963592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.93 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 		 390 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  25.28 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.93 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0445  triacylglycerol lipase  23.42 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.193973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 200 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>