231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3763 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 260 aa  503  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  41.63 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.56 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.84 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.05 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 462 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  23.65 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.17 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  24 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  27.12 
 
 		 2082 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  22.4 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.06 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  20.18 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  20.18 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  29.8 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.16 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  21.28 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  27.32 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.21 
 
 		 396 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  31.53 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30.51 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  32.23 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0606  alpha/beta fold family hydrolase  19.25 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.332573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>