More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1247 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 314 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 240 aa  116  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  30.92 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.31 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.01 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.01 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.77 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  20.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  20.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.32 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.32 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  29.02 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.93 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  20.29 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.12 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  23.81 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  24.9 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.87 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.32 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  25.85 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.74 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.43 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  26.78 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.31 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  26.45 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  25.73 
 
 		 203 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.2 
 
 		 562 aa  52.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.37 
 
 		 456 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>