More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3522 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  75.7 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  62.9 
 
 		 289 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  64.49 
 
 		 286 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  62.19 
 
 		 289 aa  354  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  44.73 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  44.57 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  44.57 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  39.27 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  38.94 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  38.94 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  38.94 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  38.94 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 253 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  39.43 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  39.43 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  38.14 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  37.68 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  36.43 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  37.45 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  37.55 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  37.55 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  37.55 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  37.88 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  34.8 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  37.18 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  30.85 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  34.21 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  32.68 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  31.38 
 
 		 585 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  34.78 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  34.77 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 594 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 594 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.58 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 591 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 599 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 599 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.8 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 589 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  26.95 
 
 		 585 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  29.04 
 
 		 586 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  28.57 
 
 		 585 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  28.57 
 
 		 585 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 585 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  28.57 
 
 		 585 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 585 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.14 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  26.95 
 
 		 585 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  31.95 
 
 		 586 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  28.22 
 
 		 580 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  26.84 
 
 		 585 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  31.58 
 
 		 586 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 578 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 590 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  24.17 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>