More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0122 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  53.78 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.34 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  22.9 
 
 		 562 aa  68.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.62 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.14 
 
 		 571 aa  65.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.41 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.99 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.96 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.2 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  27.16 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  25.83 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  21.6 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  32.46 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  32.46 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 453 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  32.46 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  25.71 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  28.93 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 397 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.79 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  23.05 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>