More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4562 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
260 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 
251 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  39.21 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  36.32 
 
 
286 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  38.77 
 
 
308 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  39.91 
 
 
303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
248 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
268 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
251 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  33.19 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.73 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.33 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.05 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.05 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.68 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.16 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.69 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  25 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.82 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.77 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  40.38 
 
 
462 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
314 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.17 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
361 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.78 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  21.71 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.44 
 
 
371 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
316 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 
266 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.63 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
299 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.29 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.7 
 
 
571 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.29 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.29 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  21.32 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
368 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  24.6 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  21.86 
 
 
296 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  24.51 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  28.17 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  21.97 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>