More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3543 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 371 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  32.17 
 
 		 387 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 387 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 316 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.97 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 294 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 371 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 371 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 363 aa  89  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 229 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.27 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.95 
 
 		 387 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.27 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.56 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  26.81 
 
 		 320 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 339 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 350 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.34 
 
 		 371 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.35 
 
 		 372 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 387 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 296 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.8 
 
 		 370 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.1 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  25.75 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.42 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.6 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.15 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.15 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.68 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>