More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1448 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
251 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
301 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
308 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
303 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  36.32 
 
 
260 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
267 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  33.5 
 
 
260 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
251 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.96 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.51 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.51 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.9 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  23.51 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.14 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.14 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.75 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.67 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
323 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
456 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.26 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  24.43 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  23.75 
 
 
510 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0172  hypothetical protein  44.07 
 
 
76 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  27.18 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  25.4 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.45 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
327 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.96 
 
 
343 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  22.44 
 
 
294 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.32 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
229 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
264 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
344 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>