45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0172 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  72.88 
 
 		 308 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  60.81 
 
 		 301 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  58.62 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.32 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 		 308 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  52.27 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.78 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 		 302 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  40.38 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  52.27 
 
 		 283 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 293 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 275 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  36.07 
 
 		 278 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 273 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  32.26 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 312 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  40 
 
 		 379 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 285 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  36.21 
 
 		 287 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 270 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 285 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 405 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 284 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>