More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2437 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
251 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
286 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 
308 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  46.36 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  43.44 
 
 
303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  45.05 
 
 
260 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.41 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
292 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
268 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
280 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
251 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
309 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3763  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.303552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  28.95 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.64 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.79 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0172  hypothetical protein  58.62 
 
 
76 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.02 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.34 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.11 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.3 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.34 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  21.68 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.57 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.42 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.97 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27 
 
 
425 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
350 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.23 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  26.88 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
354 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 
462 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
309 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
340 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.82 
 
 
370 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.17 
 
 
343 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.2 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
361 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.45 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
308 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
405 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
300 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  43.48 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  26.56 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>