More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3298 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  47.17 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  41.22 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  43.03 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 258 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  41.49 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  39.62 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  40.41 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  38.91 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  39.3 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  40.42 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  39.38 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  38.19 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  35.66 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  40.33 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  40.47 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  36.54 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  39.5 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  37.08 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  37.08 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  39.69 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  38.58 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  40.79 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  38.34 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  37.4 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  36.63 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  36.25 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  36.54 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  36.25 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  38.67 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  39.67 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 264 aa  164  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  34.75 
 
 		 235 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.59 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.4 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  33.58 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  34.65 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  28.79 
 
 		 356 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  30.34 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  30.12 
 
 		 293 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.62 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.4 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>