More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1011 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 322 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  68.46 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  46.41 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  47.02 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  43.23 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  43.65 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  43.65 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  43.65 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  43.65 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  43 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  43.37 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  43.37 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  41.45 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 345 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  32.55 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  27.03 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30.3 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 390 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 344 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  28.79 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 379 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.45 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  40.77 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  35.51 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.31 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.93 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.97 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  37.21 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.39 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  35.38 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.36 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  37.82 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>