More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54655 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  35.25 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  32.16 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  32.2 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  30.97 
 
 		 256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  32.57 
 
 		 255 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  32.7 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  31.27 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  27.03 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  30.22 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.82 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  27.59 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  28.35 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  27.91 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  29.69 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  30.12 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  28.68 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  26.72 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.74 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.68 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.84 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  28.08 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 226 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  27.69 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.03 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  27.86 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.03 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  27.69 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  25.95 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.27 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  23.42 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  22.62 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>