More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0333 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  97.54 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  80.95 
 
 
291 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  76.6 
 
 
290 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  63.41 
 
 
289 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  60.87 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  43.37 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 
302 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  42.01 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
299 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
299 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
299 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  39.41 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  39.41 
 
 
295 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
284 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 
288 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  37.67 
 
 
286 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
288 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
289 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
298 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
289 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
279 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.89 
 
 
288 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  37.41 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
287 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
277 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
283 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 
293 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 
293 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 
293 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  34.71 
 
 
293 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
277 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
288 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
274 aa  148  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
276 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  31.84 
 
 
279 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
276 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
283 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
283 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  34.87 
 
 
275 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
278 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
273 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.21 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
278 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
286 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
273 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  34.55 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 
283 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
283 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
285 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.94 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
278 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
281 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
296 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
297 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
277 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
290 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
275 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
271 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.63 
 
 
263 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
339 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
345 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
288 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
287 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
287 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
295 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>