More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
267 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.38 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
267 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
267 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
264 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.84 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.05 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2029  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.8 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
275 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
284 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.85 
 
 
256 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.39 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.73 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.12 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  29.25 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.16 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  27.45 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.94 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  28.19 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  29.47 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.47 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.33 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.83 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.34 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  28.22 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  30.41 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  28.5 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  30.41 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.77 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.7 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  28.77 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  29.19 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
313 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.94 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  30.41 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>