More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1897 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
267 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
265 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.91 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
284 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.63 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
270 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
267 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 
269 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
268 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
264 aa  99  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.37 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.1 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
268 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
263 aa  92  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
266 aa  92  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
275 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.27 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.17 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
396 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.61 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.45 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  39.17 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  39.17 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  39.17 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.84 
 
 
425 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  27.34 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  38.79 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  37.07 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  28.63 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>