More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0337 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
261 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  51.9 
 
 
285 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  49.36 
 
 
308 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  46.53 
 
 
266 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.08 
 
 
268 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  49.38 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  41.91 
 
 
264 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  38.06 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
284 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
275 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
274 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
265 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  35.15 
 
 
260 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 
285 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  34.56 
 
 
266 aa  92  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  34.93 
 
 
266 aa  92  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  31.49 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  39.05 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  33.8 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.71 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
298 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  34.01 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.01 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
260 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
300 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 
356 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  36.73 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.97 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
287 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
287 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
288 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.63 
 
 
373 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  27.97 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  29.5 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  27.97 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.56 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  27.97 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  35.51 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  30.89 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  29.12 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.57 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.96 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  28.93 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  30.17 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
298 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
331 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  29.34 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  36.73 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.3 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.35 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  28.93 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.36 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>