More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1535 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
373 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  47.85 
 
 
396 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  47.33 
 
 
392 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  42.15 
 
 
393 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  42.52 
 
 
393 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.73 
 
 
393 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  40.31 
 
 
396 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  42.12 
 
 
386 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  39.59 
 
 
391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  49.2 
 
 
262 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  49.8 
 
 
263 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  37.73 
 
 
390 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.94 
 
 
397 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.34 
 
 
402 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  46.61 
 
 
263 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  47.41 
 
 
263 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  46.22 
 
 
263 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  45.82 
 
 
263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  49.4 
 
 
263 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  46.15 
 
 
262 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  45.85 
 
 
263 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 
263 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  45.45 
 
 
263 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  38.12 
 
 
397 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  44.94 
 
 
269 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.85 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
393 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
393 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
393 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  44.18 
 
 
261 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
393 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
393 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  41.94 
 
 
260 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  43.72 
 
 
265 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  42.51 
 
 
255 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  46.44 
 
 
270 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  41.53 
 
 
261 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  46.22 
 
 
270 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  46.22 
 
 
270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.22 
 
 
400 aa  226  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  37.83 
 
 
377 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  40.73 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 
389 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  40.89 
 
 
260 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  43.2 
 
 
260 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  43.2 
 
 
260 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  45.16 
 
 
266 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  40.89 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  42.91 
 
 
259 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  44.76 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  41.53 
 
 
265 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  41.13 
 
 
265 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  41.8 
 
 
265 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  41.8 
 
 
258 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  40.73 
 
 
360 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  39.29 
 
 
261 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  40.89 
 
 
258 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  42.57 
 
 
253 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  40.16 
 
 
263 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  39.27 
 
 
260 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  37.35 
 
 
260 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  41.6 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  40.76 
 
 
261 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  40.76 
 
 
261 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  41.6 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.6 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  39.36 
 
 
263 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
261 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  40.73 
 
 
265 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  40.17 
 
 
263 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  42.17 
 
 
267 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  43.7 
 
 
263 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 
263 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  37.1 
 
 
256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  37.1 
 
 
256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  40.16 
 
 
268 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  38.15 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  39.11 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  36.69 
 
 
256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  38.25 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.6 
 
 
279 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 
282 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 
279 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
269 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  37.9 
 
 
262 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.29 
 
 
129 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
262 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  38.55 
 
 
263 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  37.86 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  37.3 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
264 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>