More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2264 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.72 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 387 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.63 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  32.42 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 562 aa  89.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 387 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.64 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.46 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 371 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.17 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 270 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28.91 
 
 		 387 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  23.25 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.85 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.53 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.96 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.39 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.15 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.21 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>