More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2696 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  89.41 
 
 		 387 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  100 
 
 		 387 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  90.18 
 
 		 387 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  88.11 
 
 		 387 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 255 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  35.66 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 268 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  33.06 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.5 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 268 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 270 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 		 261 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 254 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 271 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 265 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.64 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 265 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 		 279 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 279 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 273 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 280 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 270 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 		 263 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 260 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 271 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 265 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.52 
 
 		 254 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.75 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 266 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 272 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 270 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.52 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 260 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 260 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 285 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 278 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.05 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 270 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.64 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.67 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.68 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.82 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.7 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.7 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.9 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.99 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.48 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.09 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>