More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  44.84 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  41.15 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  36.48 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  34.89 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.52 
 
 		 387 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 387 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.43 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  26.79 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  28.29 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.36 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.84 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.84 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.47 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.09 
 
 		 370 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.33 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.83 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  26.92 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.09 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.46 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.11 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.67 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.63 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  27.93 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  22.04 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.11 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.12 
 
 		 370 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 		 368 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.3 
 
 		 368 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 381 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  27.24 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 288 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  52.08 
 
 		 331 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>