More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0565 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  34.86 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.69 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.57 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  36.79 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.06 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.48 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.96 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  21.81 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  25.1 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  22.4 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.33 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3869  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.36 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.41 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  28.76 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  31.01 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.65 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  37.11 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  25.93 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.67 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  36.08 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.8 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.64 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.95 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.23 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>