More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3348 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  99.23 
 
 
259 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  99.23 
 
 
259 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  87.5 
 
 
259 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  69.32 
 
 
252 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  48.99 
 
 
255 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.05 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  38.84 
 
 
265 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  36.44 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
251 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
275 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.75 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  28.05 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  28.05 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  37.74 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.64 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.12 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.97 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  30.29 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  29.03 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  26.97 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  25.53 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  37.76 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.41 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.9 
 
 
370 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  35.14 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
309 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  28.14 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  34.75 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
328 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  40.2 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  27.43 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.35 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  38.94 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.46 
 
 
425 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.11 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  34.1 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.47 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.38 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.46 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>