More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0937 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 302 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  31.69 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.03 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  27.24 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  27.01 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  25.96 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  30.96 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  38.64 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  27.57 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  28.57 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  28.83 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  29.13 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  29.13 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  28.67 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  27.97 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  30.91 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  25.77 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  28.29 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  27.78 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  25.77 
 
 		 301 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  29.11 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  27.46 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  27.62 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25.77 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  26.32 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  25 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  25 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  27.18 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  25.61 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  28.91 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  26.53 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  28.18 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  26.86 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  28.87 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  26.28 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  25.69 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  27.02 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  24.65 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  25.87 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  29.35 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  29.11 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  27.18 
 
 		 332 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  28.18 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  24.57 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  27.21 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  25.34 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  27.72 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  28.57 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  25.26 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  25.81 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  28.72 
 
 		 323 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2502  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.12 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2687  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  24.57 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  27.11 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  28.01 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  28.01 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  24.91 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  28.01 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  28.15 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  28.15 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  28.67 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  26.01 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  26.55 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  26.35 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  24.65 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  27.85 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  26.33 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  24.56 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  27.81 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  27.43 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>