More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1703 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  99.65 
 
 		 284 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  95.77 
 
 		 284 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  90.49 
 
 		 284 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  76.33 
 
 		 284 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  72.95 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  71.89 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  67.25 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  67.61 
 
 		 286 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  67.25 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  63.73 
 
 		 300 aa  342  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  36.8 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.07 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.45 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  39.62 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  36.69 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  35.82 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  33.76 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.68 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  31.96 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  35.15 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  31.69 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  32.23 
 
 		 359 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.1 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.73 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  28.62 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.3 
 
 		 2762 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.06 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.22 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.17 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.68 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  50.57 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  41.75 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  29.5 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.32 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>