More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  69.18 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  65.48 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  61.65 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3041  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0928  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.88 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.51 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.63 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.94 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.39 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.82 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.18 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  29.07 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  30.82 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  44.68 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  29.18 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.43 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.53 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  41.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.72 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.68 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.96 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>