More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3992 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  58.09 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  45.21 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  43.16 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  41.98 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.77 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  35.77 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  42.74 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  42.37 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  43.15 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  40.84 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.67 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  33.45 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  34.98 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  36.16 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  34.5 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  32.27 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  33.57 
 
 		 359 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  30.58 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  30.07 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  36.67 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.74 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.62 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.86 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.86 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.57 
 
 		 2762 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  35.61 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  36.89 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.07 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  37.59 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.97 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.98 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.14 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  33.62 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.15 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.98 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.05 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.04 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  35.59 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>