More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1542 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 311 aa  84.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  34.07 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  34.07 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  35.29 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 311 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.9 
 
 		 276 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 259 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  34.55 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 315 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.03 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  34.4 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.45 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  28.47 
 
 		 271 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 329 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  29.27 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.36 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 312 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.69 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 324 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.66 
 
 		 2762 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2211  alpha/beta fold family hydrolase  29.37 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  28.91 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  29.06 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  27.74 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  30.89 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  32.32 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  29.46 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  31.97 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  30.39 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  30.39 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>