More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4953 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 360 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 300 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 282 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  26.82 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  27.01 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  31.43 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  31.22 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  31.22 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  23.92 
 
 		 288 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  33.09 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  22.46 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  24.14 
 
 		 2762 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.41 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  21.4 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  24.84 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  25.47 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.1 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 543 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  35.34 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  27.64 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  25.33 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  35.65 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  25.32 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>