More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2967 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  85.39 
 
 		 308 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  85.06 
 
 		 308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  84.74 
 
 		 308 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  40.81 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  37.78 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  39.08 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  38.33 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  38.66 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  31.16 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  30.66 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.43 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.61 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  28.38 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  28.1 
 
 		 359 aa  99  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  28.42 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.17 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  31.25 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.86 
 
 		 2762 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  27.44 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  29.74 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.52 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.87 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  34.15 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34.57 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  22.64 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  21.62 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  28.88 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  32.76 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  21.62 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  21.62 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  33.82 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  27.33 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.45 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  27.27 
 
 		 3045 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>