More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
300 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  72.95 
 
 
287 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  72.89 
 
 
286 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  72.89 
 
 
286 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  66.2 
 
 
284 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  64.46 
 
 
284 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  65.49 
 
 
284 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  64.44 
 
 
284 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  64.79 
 
 
284 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  63.73 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 
284 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  38.67 
 
 
299 aa  185  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
284 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
315 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
306 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
288 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.25 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 
308 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
288 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
288 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  36.26 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  36.75 
 
 
288 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
291 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  41.51 
 
 
289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
308 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
288 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  32.09 
 
 
283 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
288 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  37.87 
 
 
308 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
288 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
288 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 
308 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
298 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.94 
 
 
279 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  38.14 
 
 
244 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  31.97 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  34.8 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  31.93 
 
 
308 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.17 
 
 
2762 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  30.97 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29 
 
 
284 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.55 
 
 
284 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  26.87 
 
 
289 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.84 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  35.68 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.84 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  35.23 
 
 
3045 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  43.52 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  43.69 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  43.4 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  39.25 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  30.66 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>