More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3736 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  96.13 
 
 		 284 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  95.77 
 
 		 284 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  90.14 
 
 		 284 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  77.03 
 
 		 284 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  72.95 
 
 		 284 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  73.67 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  67.61 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  68.66 
 
 		 286 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  68.31 
 
 		 286 aa  351  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  64.79 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  36.06 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.61 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.45 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  35.96 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  33.44 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  35.56 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  28.98 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.4 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  32.23 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  30.45 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.67 
 
 		 2762 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.73 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28.96 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.92 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.06 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.19 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.82 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.02 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.02 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.17 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  30.08 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  31.51 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  29.17 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  34.26 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  34.26 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  33.66 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  34.26 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  33.08 
 
 		 3045 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>