More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2742 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
306 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
306 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  98.55 
 
 
275 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
290 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  39.19 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 
2762 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  39.34 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
607 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  27.9 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  28.46 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  29.15 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  35.51 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28.24 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.24 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  52.38 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  38.1 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  40.68 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  38.21 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  23.6 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.53 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  34.92 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  35.71 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  29.12 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.97 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.54 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  36.84 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 
626 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  31.32 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.67 
 
 
259 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  28.46 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
288 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
255 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  37.19 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  33.69 
 
 
304 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
255 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
363 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>