More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45778 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  100 
 
 
359 aa  749    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
315 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  34.77 
 
 
284 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34.42 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  30.3 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
306 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 
289 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  34.23 
 
 
286 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
284 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  33.94 
 
 
284 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  31.48 
 
 
255 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  34.44 
 
 
286 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
287 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
284 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
284 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  33.72 
 
 
284 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  28.76 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.58 
 
 
284 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  29.54 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.62 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  31.73 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
288 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
288 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
288 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
288 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  29.21 
 
 
289 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
297 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 
311 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
298 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
291 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
308 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
294 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  29.09 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 
308 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.38 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.53 
 
 
2762 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
289 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.75 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 
285 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
309 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.51 
 
 
296 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
296 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
340 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  32.14 
 
 
307 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
311 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
296 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
504 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  29.23 
 
 
494 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  30.88 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
474 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
258 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>