More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5407 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
296 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  96.62 
 
 
296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  96.28 
 
 
296 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  96.28 
 
 
296 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  93.58 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  93.92 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  92.23 
 
 
296 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
300 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
340 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
296 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
296 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
296 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  85.47 
 
 
349 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  85.81 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  85.47 
 
 
296 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  81.57 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  78.16 
 
 
294 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  77.13 
 
 
294 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  64.51 
 
 
297 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  63.01 
 
 
305 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  62.89 
 
 
305 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  63.82 
 
 
297 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  62.54 
 
 
307 aa  359  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  50 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  49.66 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  51.51 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  51.01 
 
 
311 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  48.86 
 
 
309 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
295 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  48.62 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 
339 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 
313 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
343 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
289 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  48.14 
 
 
307 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
325 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
309 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.64 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
359 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28.23 
 
 
282 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.89 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.09 
 
 
2762 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  30.82 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  34.07 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  36.24 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  27.46 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.11 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  33.02 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  32.55 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 
239 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.81 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 
590 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  34.44 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
474 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>