More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1153 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  67.43 
 
 
311 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  67.11 
 
 
311 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  63.14 
 
 
313 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  67.1 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  61.54 
 
 
299 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  56.85 
 
 
343 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  61.56 
 
 
309 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  53.27 
 
 
312 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 
297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  51.84 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  52.84 
 
 
307 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  52.15 
 
 
297 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  50.17 
 
 
296 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
296 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
296 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  48.14 
 
 
349 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
296 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  54.17 
 
 
339 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  48.47 
 
 
296 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 
296 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  48.14 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
294 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 
302 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  50 
 
 
294 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  48.14 
 
 
296 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
296 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 
296 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 
296 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 
296 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  44.81 
 
 
295 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 
300 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 
309 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
289 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
289 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
289 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.8 
 
 
285 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31.89 
 
 
290 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  31.82 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
288 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
288 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
288 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  28.33 
 
 
289 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  30.84 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.31 
 
 
2762 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.81 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  25.77 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  25.26 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  25.37 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  23.87 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  24 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>