More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2101 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  95.67 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  78.57 
 
 		 294 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  70.07 
 
 		 298 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  69.76 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  65.72 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  64.34 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  64.34 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  64.91 
 
 		 291 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  65.02 
 
 		 297 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  62.02 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  63.29 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  63.29 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  64.31 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  63.29 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  59.25 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  57.99 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  52.82 
 
 		 294 aa  315  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  52.55 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  50.17 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  49.15 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  48.81 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  46.85 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  36.7 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 861 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 875 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.8 
 
 		 922 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  32.9 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 927 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.69 
 
 		 922 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.99 
 
 		 978 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.45 
 
 		 899 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.21 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.43 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  28.77 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 915 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  29.74 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  27.85 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.9 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  27.33 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  27.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  28.86 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  33.78 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  30.18 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  30.18 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  30.18 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  30.1 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  27.18 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  25.33 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 405 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  28.62 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  27 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  29 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.18 
 
 		 639 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 323 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.65 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  28.91 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  24.47 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  26.21 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>